El panorama evolutivo de la variante B.1.1.519 del SARS-CoV-2 y su impacto clínico en la Ciudad de México

Resumen
La pandemia del SARS-CoV-2 es uno de los problemas de salud más preocupantes en todo el mundo. Nosotros reportamos la aparición de la variante B.1.1.519 del SARS-CoV-2 en la Ciudad de México. Informamos el número de reproducción efectivo (Rt) de B.1.1.519 y presentamos evidencia de su origen geográfico basado en el análisis filogenético. También estudiamos su evolución a través del análisis de haplotipo e identificamos los haplotipos más recurrentes. Finalmente, estudiamos el impacto clínico de B.1.1.519.
La variante B.1.1.519 fue predominante entre noviembre de 2020 y mayo de 2021, alcanzando el 90% de todos los casos secuenciados en febrero de 2021. Se caracteriza por tres cambios de aminoácidos en la proteína de espiga: T478K, P681H y T732A. Su Rt varía entre 0.5 y 2.9. Su origen geográfico aún no se ha investigado. Los pacientes infectados con la variante B.1.1.519 mostraron un aumento de probabilidad ajustado (aOR) altamente significativo de 1.85 sobre los pacientes sin B.1.1.519 para desarrollar un resultado severo/crítico (p=0.000296, 1.33–2.6 IC 95%) y un aumento de 2.35 veces para la hospitalización (p=0.005, 1.32–4.34 IC 95%). Se requerirá el monitoreo continuo de esta y otras variantes para controlar la pandemia en curso a medida que evoluciona.

Palabras clave: SARS-CoV-2; B.1.1.519 variante; Número de reproducción efectivo; Análisis filogenético; Análisis de haplotipo; Impacto clínico; Odds ratio ajustado significativo; Hospitalización COVID-19; COVID-19 Resultado crítico