Preprint: Reinfecciones de COVID-19 en la Ciudad de México: implicaciones para la respuesta de salud pública

Resumen

Antecedentes

La pandemia SARS-CoV-2 continúa siendo importante incluso cuando más del 60% de la población mundial ha sido vacunada. A medida que la pandemia evoluciona, el número de casos de reinfección continuará aumentando a medida que se generan nuevas variantes que evaden la respuesta inmune. Comprender las reinfecciones es importante para guiar al sistema de salud pública e informar a los tomadores de decisiones.

Métodos

Descargamos el resultado clínico y la gravedad de la infección de los datos de la base de datos SISVER (Sistema de Vigilancia Epidemiológica de Enfermedades Respiratorias). Secuenciamos muestras SARS-CoV-2, identificamos el linaje SARS-CoV-2 y cargamos estos datos genómicos para GISAID. Analizamos el tiempo y el linaje entre la infección por índice y la reinfección. También analizamos el resultado clínico, la gravedad de la infección y el estado de vacunación durante las reinfecciones.

Recomendaciones

En este estudio confirmamos que cada ola de infecciones SARS-CoV-2 se caracterizó por una variante viral diferente que muestra una alta prevalencia de más del 95%. Encontramos que la fracción de reinfección no está relacionada linealmente con el tiempo promedio de separación entre las olas con el 40% de todas las reinfecciones ocurriendo ola 5, la única ola con más de una variante SARS-CoV-2 con una prevalencia superior a 80%. Con respecto al tipo de atención, el 2.63% de los pacientes se consideraron ambulatorios durante la reinfección, incluso cuando fueron hospitalizados durante el índice de la infección y solo el 0.78% presentó el comportamiento opuesto. Además, 6.74% reinfecciones transicionaron de asintomático a leve o grave o de leve a grave; y el 8.95% transición de severo a leve o asintomático o de leve a asintomático. El mayor número de reinfecciones ha ocurrido en pacientes no vacunados (41.6%), seguido en breve por pacientes vacunados (31.9%). Sin embargo, la mayoría de las reinfecciones ocurrieron después de la ola 4 cuando los esfuerzos de vacunación nacional han alcanzado el 65% de la población general.

Interpretación

Los datos analizados sugieren una disminución de la gravedad de la infección durante la reinfección, ya sea si se consideran las transiciones en la gravedad de la enfermedad o las transiciones en el tipo de atención al paciente. Finalmente, también observamos una sobrerrepresentación de pacientes no vacunados en reinfecciones.